Evo 2 の内部表現をスパースオートエンコーダで読む

Evo 2 の埋め込みを SAE で 32768 個の特徴に分解し, 大腸菌ゲノムとタンパク質の立体構造の上に 読み出します. Google Colab で実行できます.

第 1 部 ゲノムトラックと立体構造への読み出し

Open in Colab

第 2 部 アノテーションによる特徴の選択

Open in Colab

第 3 部 DSSP・配列書き換え・プロファージ間の比較

Open in Colab

付録 左文脈・エンコード・活性行列

Open in Colab